Светът бавно се превръща в едно ужасно и непризнато място – такова, в което Библиотеката никога не е съществувала. Затова ще се наложи библиотекарите да се съберат заедно, преди всичко да се е върнало в начална позиция – без капка знание и в пълна тъмнина. Флин Карсен (Ноа Уайли) ще получи тревожно предупреждение от миналото, че може да има само един библиотекар, за да не се случва поредната гражданска война сред библиотекарите. Това принуждава Флин да вземе съдбоносно решение, което Ева Байрд (Ребека Ромин) не иска да направи. Нейното колебание кара Библиотеката да подложи екипа на съд, за да реши кой най-накрая ще поеме мантията на единствения и истински библиотекар. Процесът обаче води до неочаквани последици, които застрашават самото съществуване на Библиотеката. Кристиан Кейн, Линди Бут и Джон Харлан Ким се завръщат като библиотекарите Джейкъб Стоун, Касандра Килиан и Езекиел Джоунс. Джон Ларокет играе ролята си на Дженкинс, а специалните гостуващи звезди в този сезон включват Рейчъл Никълс като Никол Ноуан и Самюъл Рукин като Дарингтън Деър. Друга специалнa гостуваща звезда този сезон ще бъде Джон Нобъл, носител на наградата на Гилдията на филмовите актьори за ролята си на Денетор във "Властелинът на пръстените". Нобъл ще влезе в ролята на Монсиньор Вега, ватикански епископ и таен началник на еретичния ред на Сенките. Към сюжетното действие ще се присъедини и Рейчъл Никълс, популярна с участието си в "От глупав по-по-глупав: Когато Хари срещна Лойд", "Наричана още", Престъпни намерения" и "Континуум".
Библиотеката е тайна организация, която в продължение на векове събира артефакти с магия и сила, твърде опасни, за да бъдат в ръцете на смъртни; побеждава чудовища, които ловуват невинни, и разгадава древни загадки с ужасяваща сила. През всичкото това време Библиотеката винаги е имала един библиотекар – учен, който да разгадава тези загадки – и един охранител, който да пази този библиотекар жив. Тази двойка, заменяна след смъртта на всеки предишен екип, бди над един свят, в който магията в очите на обществото отдавна е изчезнала като легенда. Когато древна конспирация заплашва да унищожи технологиите и да върне епохата на магията, Флин и новата му пазителка Ив Бърд трябва да привлекат трима необикновени хора – таен учен/ковчежник, който работи по петролопровод, болничен санитар, който има необикновената дарба на синестезия (способността да свързва всичките пет сетива с паметта си) и крадец от световна класа, за да се включат в търсенето. Ако тези новобранци се провалят, светът ще бъде потопен в нова тъмна епоха. Но ако успеят (и оцелеят), те ще се превърнат в новите Библиотекари.
Действието в сериала е насочено към тайна организация, чието седалище е Обществената библиотека в Метрополитан. Тя се занимава с разгадаването на мистерии, бори се със свръхестествени сили и търси тайнствени артефакти от целия свят. Флин Карсън (Уайли) работи като библиотекар в продължение на повече от 10 години, за да защитава артефактите и да ги предпазва от това да попаднат в грешни ръце. С течение на времето обаче, тази работа започва да става непосилна за него и от библиотеката наемат четирима души, които да му помагат: Ева Биърд (Ромейн), агентка, която се бори с тероризма и е отговорна за здравето и живота на екипа; Джейк Стоун (Кейн), работник от Оклахома с IQ 190 и огромни познания за историята на изкуствата; Касандра (Бут), чудата млада дама със свръхестествени способности и халюцинации, свързани с миналото, и Есекиел Джоунс (Ким), цар на новите технологии и познавач на класическите престъпления, който се забавлява в ролята си на търсач на мистерии. Надзирател на екипа от библиотекари е Дженкинс (Джон Ларокет), експерт в областта на древните мистерии и науки. Всички заедно трябва да се справят с много неприятели, най-големият от които е "Братството на Змията", древен култ, предвождан от мистериозен и могъщ водач, в чиято роля ще се превъплъти Фрюър.