Джейсън Борн предизвиква пожар, който заплашва да изпепели десетилетия изследвания в редица тайни разузнавателни агенции. Тогава Ерик Байър (Едуард Нортън), човекът, създал програмите, решава, че трябва да пожертва една от тях. Резултатът е смъртоносна гонка, в която Байър се стреми да унищожи изследователката Марта и Kрос -агентът на Outcome.