През 2387г. свръхнова заплашва да унищожи родния свят на ромуланците. Вулканците, водени от Спок, построяват кораб, който да носи "червена материя", която веднъж възпламенена може да създаде гравитационна сингулярност, карайки свръхновата да бъде погълната от черна дупка. Въпреки това те закъсняват да спасят Ромулус и свръхновата почти унищожава цялата раса. Капитан Неро от ромуланците със кораба Нарада, гледа как семейството му и родния му свят умират, и се опитва да си отмъсти на Спок, но и двата кораба са хванати в хоризонта на събитие на черната дупка, те се връщат в миналото и създават "алтернативна" времева линия различна от "Оригиналният сериал". Нарада пристига около 150 г. преди инцидента и прави обсада на кораба на Федерацията, USS Келвин. Неро иска нейният капитан, Ричард Робау, да се предаде и научава, че Спок още не е пристигнал. Неро убива Робау и заповядва унищожението на кораба. Докато екипажа на Келвин се евакуира действащия капитан Джордж Кърк е принуден да остане, за да направи прикритие на совалките и умира малко след като синът му, Джеймс Тибериус Кърк, е роден. Екипажът на Нарада изчислява, че поради хоризонта на събитие Спок ще се появи след около 20 г. и тихо го изчакват. Когато Спок пристига Неро хваща кораба му и останалата "червена материя" и прогонва Спок на планетата Делта Вега близо до Вулкан, казвайки му да се приготви да гледа как родната му планета ще бъде унищожена.
След експлозия на тяхната луна, клингоните имат приблизително 50 години преди озоновият им слой да бъде напълно разреден и всички те да умрат. Те имат само един избор _ да сключат мир с Федерацията, което ще означава край на 70-годишния конфликт. Капитан Джеймс Т. Кърк и екипажът са призовани да помогнат в преговорите поради предишния им "опита" с тях. Но мирните преговори не продължават дълго и Кърк и Маккой са осъдени за убийството на върховния клигонски канцлер. Двамата са затворени в снежния затворнически лагер за тежък труд Рура Пенте. Ще успеят ли да избягат? И ще постигнат ли някога мир с клингоните?
Тестването на новокръстения космически кораб Ентърпрайз не върви добре, затова капитан Кърк и екипажът му го връщат обратно в базата за поправка. Ваканцията им на брега на Земята е прекъсната от изгубения полубрат на Спок _ Сибок, който държи като заложници трима посланици на планетата Нимбус III. Това събитие също привлича вниманието на клингонски капитан и решен да се прочуе, той тръгва да преследва Ентърпрайз. Разхайтената армия на Сибок превзема Ентърпрайз и я отвежда на пътешествие до центъра на галактиката в търсене на най-висшето същество.
Уилям Шатнър, Леонард Нимой и останалата част от екипа на Ентърпрайз се издигат в небето в едно от най-аплодираните и интригуващи приключения на "Стар Трек". 23-ти век е и мистериозна извънземна сила заплашва Земята, като изпарява океаните и унищожава атмосферата. В неистов опит да спасят човечеството, Кърк и екипажът му трябва да се върнат назад във времето в Сан Франциско през 1986 г., където откриват свят на пънк, пица и градски транспорт, които са толкова извънземни, колкото всичко, което някога са срещали в далечните краища на галактиката. Вълнуваща и наситена с екшън, тази мисия на Стар Трек едновременно ще ви завладее и усмихне!
Поражението на адмирал Кърк над Хан и създаването на планетата Генезис са празни победи. Спок (Леонард Нимой) е мъртъв, а Маккой необяснимо е полудял. Но изненадващо посещение на Сарек, бащата на Спок, предоставя изумително разкритие: Маккой носи в себе си живата същност на Спок. Кърк не се колебае и рискува кариерата си, като похищава изведения от експлоатация U.S.S. Ентърпрайз, за да се отправи към планета Генезис и спаси приятелите си. Но Клингоните също са научили за силата на Битие и бързат да настигнат Кърк за смъртоносна среща.
През 23-ти век Ентърпрайз е изпратен в обсега на гигантско енергийно поле, което заплашва да погълне два кораба. Капитан Кърк (Уилям Шатнър) предотвратява бедствието, но става жертва на полето и се смята за мъртъв. Години по-късно новият командир на Ентърпрайз, капитан Пикард (Патрик Стюарт), научава, че един от оцелелите от катастрофата, д-р Соран (Малкълм Макдауъл), планира да погуби милиони животи, като унищожи съседна звезда. Сега Пикард трябва да намери начин да си сътрудничи с легендарния Кърк, за да го спре.